Página Inicial a Protein Explorer

Traducción al Español por Gabriel Pons. Departamento de Ciencias Fisiológicas II.
Universidad de Barcelona. 2004

¿Qué es Protein Explorer? ¿Qué es nuevo? Para empezar, hacer click aquí:

Inicio Fácil a Protein Explorer para explorar un complejo molecular entre DNA y una proteína
(regulador de la transcripción Gal4, de levadura, código de identificación PDB 1d66).
Realice un Paseo de 1 hora para una introducción a Protein Explorer.
¿No le funciona PE? Aquí encontrará una Ayuda para resolver problemas
Más moléculas de Inicio fácil
Pequeñas, funcionan bien con modem:

Complejo entre el dominio SH3 y un péptido (proto-oncogen CRK, 1b07)
Complejo Represor lac:DNA con hidrógenos RMN (3 modelos, 1lcd)

Más grandes, lentos con modem:

Anticuerpo Complejo Fab:Lisozima (1fdl)
Protein Comparator: comparación entre dos proteínas, una soluble (desoxihemoglobina, 2hhd) versus una insoluble (canal de potasio, 1bl8). En Vistas Rápidas, pruebe la opción COLOR, Polaridad3.

Atlas de Macromoléculas

Encuentre cualquier Molécula

Encuentre el código de identificación PDB de cualquier molécula

Entre cualquier código de Identification PDB aquí:

(o para 2 códigos, utilice Comparator,
o entre la URL de la molécula.)

Crear enlaces que pre-especifican moléculas
Descargar archivos PDB
"Protein explorer Directo" Explorer o Comparator (sin moléculas pre-especificadas)

ventana abierta de forma óptima (grande) para nuevas sesiones.
Acerca de Protein Explorer
(enlaces en cursiva acceden a archivos no traducidos)

Pinceladas de PE en acción
Tutorial de 1 hora, FAQ, Ayuda/Índice/Glosario, y Tutorial extenso.
Planes para lecciones y Evaluación.
Qué hay nuevo en esta versión
Cuál es la finalidad de Protein Explorer?
Protein Explorer vs. RasMol
Copyright © 2003 por Eric Martz

PE y Literatura sobre Proteínas.
Presentaciones en PE.
Planes futuros, Li mitaciones conocidas.
Descargar Protein Explorer para uso sin conexión.
Seminarios con Workshops.
Agradecimientos.

Sobre la estructura de las proteínas

Aspectos generales sobre la estructura de las proteínas
Mi literatura favorita sobre estructura de proteínas
Recursos Bioinformáticos sobre estructura de proteínas
Atlas de Macromoléculas

Protein Explorer Copyright © 1998-2003 por Eric Martz. PE se ofrece como un programa libre. Cualquier problema derivado de su uso corre a cargo del usuario. Las copias descargadas o derivadas no pueden redistribuirse en CD, servirse en sitios web accesibles públicamente, ni redistribuirse por otro medio sin permiso. Está autorizado establecer enlaces a http://www.umass.edu/microbio/chime/explorer libremente desde otras páginas web, siempre que no se cobre ninguna cuota para acceder. Está autorizado distribuir de forma local PE a los estudiantes en clases o instituciones educativas o a partir de servidores intranet o vía CD siempre que no se cobre por ello. Patrocinado por Division of Undergraduate Education of the National Science Foundation, y la University of Massachusetts. Agradecimientos.

Dos moléculas: Si desea comparar 2 archivos PDB ("dos moléculas") una junto a otra, introduzca los 2 códigos PDB en las ventanas siguientes y haga click en el botón.

Cómo encontrar moléculas

Las estructuras publicadas de macromoléculas se encuentran archivadas en el Protein Data Bank (PDB). La forma más común de entrar en Protein Explorer es buscando la molécula que desee y haciendo click en el enlace a Protein Explorer que se encuentra en la página que contiene el resultado de su búsqueda. O bien, anote el código PDB, e introdúzcalo en la ventana superior.

Enlaces que pre-especifican Moléculas

Ud puede crear páginas web que contengan enlaces que pre-especifican moléculas para ser presentadas en Protein Explorer o Comparator. Ejemplos:

Archivos PDB descargados

Puede descargar archivos PDB para mantenerlos en su disco duro local. La forma más simple para quien empieza es descargar los archivos PDB utilizando PDB Lite.

Cuando utilice PE sin moléculas pre-especificadas, puede usar su Botón Búsqueda para localizar y cargar los archivos PDB guardados en su disco duro. PE recuerda los últimos 10 archivos que ha cargado en la página con la opción "Cargar Moléculas" , y le ofrece recordárselas a partir de una lista. Otra opción es construir su propia página HTML en la que se encuentren enlaces con sus moléculas favoritas.

			< (Recargue la página para reiniciar.) Las imágenes de la izquierda se han preparado con Protein Explorer. GIFs animados Protein Explorer funciona correctamente con linux u otras plataformas unix . Además de Protein Explorer, Acceda a otros recursos basados en Chime , que incluyen tutoriales sobre DNA, Hemoglobina, Anticuerpos, plantillas para preparar sus propias presentaciones en web basadas en Chime, y el Índice mundial de recursos sobre Visualización Molecular, y más.
Regiones conservadas evolutivamente obtenidas a partir del servidor ConSurf y la herramienta MSA3D.	Animaciones: Mano EF de unión al calcio (movimiento conformacional)	GIF animado creado con PE (movimiento de unión de un inhibidor a una enzima).