Giros y rotaciones

Muy pocas de las posibilidades mostradas en esta página están disponibles a través del menú Chime.
Para deshacer todos los giros y volver a la posición inicial, pulsa el botón "Deshacer" o escribe reset en la línea de comandos.
Mostrar los ejes de color rojo
Se muestran los 3 ejes de coordenadas de color rojo, ya que el color por defecto es el blanco y no se ven. Advierte que la letra se coloca en el extremo del eje "positivo". También se muestra la representación en forma de cintas 3D (cartoons) con distintos colores para las estructuras.
Rotar 30° en torno a X
Rota la molécula una única vez 30° en torno al eje X
Rotar 45° en torno a Y
Rota la molécula una única vez 45° en torno al eje Y
Rotar 180° en torno a Z
Rota la molécula una única vez 180° en torno al eje Z
Deshacer
Elimina todos los movimientos hechos y restablece las coordenadas y posición original de la molécula
Poner en rotación continua
Comienza la rotación de la molécula en torno al eje actual con los valores por defecto (normalmente 10 °/s en torno al eje Y)
Detener la rotación
Detiene la rotación
Establecer como velocidad de rotación a grados por segundo en torno al eje y comenzar a girar
Escoge como eje de rotación la coordenada seleccionada en el menú. Establece la velocidad del giro al ángulo escogido en el menú.
Ocultar los ejes
Se ocultan los 3 ejes de coordenadas

Todo estos movimientos y muchos más también pueden realizarse de manera animada, de forma que podemos ver cómo la molécula cambia desde la posición incial a la final. Para ello hay que utilizar el comando move cuy sintaxis es la siguiente:

move Xrot Yrot ZRot Zoom XTrans YTrans ZTrans Slab TotalTime [FPS]

XRot - Número entero que establece el ángulo (en grados) que rotará la estructura en torno al eje X. Los valores positivos la hacen girar hacia abajo.
YRot - Como el anterior, pero en torno al eje Y. Los valores positivos hacen giar hacia la derecha
ZRot - Número entero que establece el ángulo (en grados) para rotar la estructura en torno al eje Z. Valores positivos hacen girar la estructura en el sentido de las agujas del rejo.
Zoom - Cambia la magnificación de la imagen. El menor valor admitido es 1 y el máximo depende del tamaño de la figura mostrada. Los positivos aumentan y los negativos disminuyen
XTrans - Controla el desplazamiento de la molécula a lo largo del eje X entre las posiciones -100 y 100. Positivos hacia la derecha y negativos hacia la izquierda
YTrans - Controla el desplazamiento de la molécula a lo largo del eje Y entre las posiciones -100 y 100. Positivos hacia abajo y negativos hacia arriba
ZTrans - Controla el desplazamiento de la molécula entre las posiciones -100 y 100. El desplazamiento provoca una rotación.
Slab - Valores entre 0 (fondo) y 100 (delante) para controlar el porcentaje de la molécula que se muestra (plano de corte)
TotalTime - El tiempo en segundos que debe durar la animación.
FPS - (optativo) Las imágenes por segundo que se mostrarán. Por defecto son 30, aunque en ordenadores lentos, Chime lo disminuye para mantener los tiempos

De esta forma, los movimientos anteriores se pueden seguir de la siguiente manera:
Rotar 30° en torno a X en 1 s
Rotar 45° en torno a Y en 1 s
Rotar 180° en torno a Z en 2 s
Deshacer
Realizar las tres rotaciones simultáneamente en 2 s
Realizar las tres rotaciones simultáneamente en 2 s con más detalle (si tu ordenador es potente)
Realizar las tres rotaciones simultáneamente en 2 s con menos detalle

Preguntas:

  1. Describe las rotaciones que hay que hacer para que, partiendo de la posición original, la molécula muestre el barril ß visto desde un extremo.
  2. Pon la molécula a girar a 30° por segundo en torno al eje Z
  3. Mantén rotando durante 5 s la molécula a 10° por segundo en torno a los tres ejes simultáneamente

Restablecer


Lecciones disponibles:

  1. Presentación
  2. Manejo del ratón y aparición del menú Chime
  3. Alteraciones del modo de representación (Display)
  4. Uso de los colores
  5. Seleccionar partes
  6. Puentes de hidrógeno y puentes disulfuro
  7. Giros y rotaciones
  8. Traslaciones, cambios de tamaño y centrado
  9. Abrir y cerrar ficheros de moléculas
  10. Guardar representaciones (scripts y gráficos)
  11. Efectos especiales de representación
  12. Generar superficies moleculares
  13. Distancias y ángulos