CINÉTICA ENZIMÁTICA
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A continuación, se describirán los siguientes conceptos: |
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CONCEPTOS BÁSICOS DE CINÉTICA QUÍMICA
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En una reacción de orden cero, la velocidad de formación del producto es independiente de la concentración de sustrato: v = k En una reacción de primer orden la velocidad de formación de los productos es directamente proporcional a la concentración del sustrato: v = k [A]. Así, en la reacción:
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La velocidad de hidrólisis de la sacarosa es, en todo momento, proporcional a la concentración de sacarosa. Dicho matemáticamente, donde [A] es la concentración de sacarosa a cada tiempo (t) y k es la constante de proporcionalidad. Se dice que ésta es una reacción de primer orden. Una reacción de segundo orden es aquella en la que la velocidad de formación del producto depende
En la tabla siguiente se resumen los distintos tipos de reacción, y la forma de calcular sus parámetros cinéticos.
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Al
seguir la velocidad de aparición de producto (o de desaparición del sustrato)
en función del tiempo se obtiene la llamada curva de avance de la reacción,
o simplemente, la cinética de la reacción. A medida que la reacción transcurre,
la velocidad de acumulación del producto va disminuyendo porque se va consumiendo
el sustrato de la reacción (Figura de la derecha).
Para evitar esta complicación se procede a medir la velocidad inicial
de la reacción (v0). La velocidad inicial de la reacción
es igual a la pendiente de la curva de avance a tiempo cero (Figura de la
derecha). De esta forma, la medida de v0 se realiza antes de
que se consuma el 10% del total del sustrato, de forma que pueda considerarse
la [S] como esencialmente constante a lo largo del experimento. Además,
en estas condiciones no es necesario considerar la reacción inversa,
ya que la cantidad de producto formada es tan pequeña que la reacción inversa
apenas ocurre. De esta forma se simplifican enormemente las ecuaciones de
velocidad. |
Para
estudiar la cinética enzimática se mide el efecto de la concentración
inicial de sustrato sobre la velocidad inicial de la reacción, manteniendo
la cantidad de enzima constante. Si representamos v0 frente a
[S]0 obtenemos una gráfica como la de la Figura de la
derecha. Cuando [S]0 es pequeña, la velocidad inicial
es directamente proporcional a la concentración de sustrato, y por tanto,
la reacción es de primer orden. A altas [S]0, el
enzima se encuentra saturada por el sustrato, y la velocidad ya no depende
de [S]0. En este punto, la reacción es de orden cero y
la velocidad es máxima (Vmax). |
MODELO CINÉTICO DE MICHAELIS-MENTEN
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Para explicar la relación oservada entre la velocidad inicial (v0) y la concentración inicial de sustrato ([S]0) Michaelis y Menten propusieron que las reacciones catalizadas enzimáticamente ocurren en dos etapas: En la primera etapa se forma el complejo enzima-sustrato y en la segunda, el complejo enzima-sustrato da lugar a la formación del producto, liberando el enzima libre:
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En este esquema, k1, k2 y k3
son las constantes cinéticas individuales de cada proceso y también
reciben el nombre de constantes microscópicas de velocidad. Según
esto, podemos afirmar que:
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Se puede distinguir entre enzima libre (E) y enzima unido al sustrato (ES), de forma que la concentración total de enzima, [ET], (que es constante a lo largo de la reacción) es: [ET] = [E] + [ES] Como [E] = [ET] - [ES], resulta que: v1= k1[S] [ET] - k1 [S] [ES] |
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v1 = v2 + v3 Además, como [ES] es constante, la velocidad de formación de los productos es constante: v = v3 = k3 [ES] = constante. |
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Como v1=v2+v3, podemos decir que: k1[S] [ET] - k1 [S] [ES] = k2 [ES] + k3 [ES] Despejando [ES], queda que:
Por lo tanto, en el estado estacionario, la velocidad de formación del producto es:
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Para cualquier reacción enzimática, [ET], k3 y KM son constantes. Vamos a considerar dos casos extremos:
Si introducimos el parámetro Vmax en la ecuación general de la velocidad, (la fórmula recuadrada anteriormente), obtenemos la expresión más conocida de la ecuación de Michaelis-Menten:
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Hay enzimas que no obedecen la ecuación de Michaelis-Menten. Se dice que su cinética no es Michaeliana. Esto ocurre con los enzimas alostéricos, cuya gráfica v frente a [S] no es una hipérbola, sino una sigmoide (Figura de la derecha). En la cinética sigmoidea, pequeñas variaciones en la [S] en una zona crítica (cercana a la KM) se traduce en grandes variaciones en la velocidad de reacción. |
CÁLCULO DE LA KM Y DE LA Vmax DE UN ENZIMA
La representación gráfica de la ecuación de Michaelis-Menten (v0 frente a [S]0) es una hipérbola (Figura de la izquierda). La Vmax corresponde al valor máximo al que tiende la curva experimental, y la KM corresponde a la concentración de sustrato a la cual la velocidad de la reacción es la mitad de la Vmax. |
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De esta forma, a partir de los datos experimentales se puede calcular gráficamente, los valores de KM y Vmax de un enzima para diversos sustratos. |
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Se define la unidad de actividad enzimática (U) como la cantidad de enzima que cataliza la conversión de 1 µmol de sustrato en un minuto. La actividad específica es el número de unidades de enzima por miligramo de proteína (U/mg prot) o por mililitro de disolución (U/ml). Recientemente, el Sistema Internacional de unidades (SI) ha definido la unidad de actividad enzimática como la cantidad de enzima que transforma 1 mol de sustrato por segundo. Esta unidad se llama katal (kat). Como 1 mol son 106 µmoles y 1 minuto son 60 segundos, resulta que 1 katal equivale a 60 x 106 U. Esta unidad es muy grande, de forma que se utilizan frecuentemente los submúltiplos como el microkatal (µkat, 10-6 kat) o el nanokatal (nkat, 10-9 kat). Cuando se conoce el peso molecular del enzima puro y el número de centros activos por molécula de enzima, las medidas de actividad enzimática permiten calcular el número de recambio del enzima, o sea, el número de reacciones elementales que realiza el enzima por cada centro activo y por unidad de tiempo. |
MOTIVOS QUE HACEN DE KM UN PARÁMETRO CINÉTICO IMPORTANTE
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La constante de Michaelis-Menten (KM) es un parámetro cinético importante pór múltiples razones:
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