Los tRNAs o RNAs de transferencia son moléculas de hebra sencilla que adoptan un plegamiento o estructura tridimensional característica, en forma de L.
(La estructura secundaria que da lugar a este plegamiento o estructura terciaria es la llamada en hoja de trébol )

Como se observa, existen unas regiones donde la molécula adopta una doble hélice intracatenaria. Esto ocurre gracias a la formación de puentes de hidrógeno entre bases complementarias de dos zonas de la misma cadena:

MOSTRAR

OCULTAR

	Bases apareadas
	Bases no apareadas

Estos enlaces hacen que se adopte el plegamiento tridimensional, dándole a la molécula su estructura tridimensional característica.

Las zonas apareadas definen cuatro brazos o asas en la estructura del tRNA; ordenados de 5' a 3' son:

Brazo aceptor del aminoácido
Brazo D o DHU
Brazo del anticodón
Brazo T o TYC

Cada brazo tiene una región apareada, o tallo (stem), y otra no apareada en su extremo, o bucle (loop).

Además de los 4 brazos, existe otra región, de longitud variable, que puede o no aparear sus bases: el Brazo variable.

Vistas axiales a lo largo de los dos brazos de la "L":
(Detener antes la rotación)

sobre el eje del brazo aceptor (con el extremo 5' en primer plano, y el 3' un poco más atrás)

sobre el eje del brazo del anticodón (con el anticodón en primer plano)

Sobre el modelo espacial compacto veamos algunas zonas funcionalmente importantes de la molécula:

Esqueleto

Bases

Nucleótido del extremo 5' :

Esqueleto

Base

Nucleótido del extremo 3' :

Esqueleto

Base

Anticodón :

Esqueleto

Bases

Volvamos a la representación simplificada. El ejemplo que hemos visto corresponde al tRNA de levadura específico para fenilalanina (tRNA^Phe).
Veamos otro ejemplo, en el cual el brazo variable (zona engrosada) es mayor: (tRNA^Ser de levadura).
(sobre esta molécula los botones de ocultar y mostrar bases no actuarán correctamente)