Obtenga cristales de alta calidad.
- Generalmente se prueban cientos de condiciones de cristalización diferentes.
- Los cristales tienen que estar sueltos (sin pegarse unos con otros), suficientemente grandes,
y preferentemente ni en forma de agujas u hojas.
- Los cristales con gran número de copias en la unidad asimétrica son problemáticos.
- Aproximadamente la mitad de las proteínas solubles que se expresan de forma eficiente cristalizan, pero únicamente un tercio de estos cristales son útiles.
Frecuencias globales de éxito (Thornton):
-
1-4%
para eucariotas
- Probablemente
10-15% mayor
para procariotas.
A principios de 2004, de los 24.000 objetivos clonados,
600 habían sido resueltos
(3%).
De éstos, ~500 objetivos resueltos no-redundantes representan
el 3% de las 16,000-dianas de la Genómica Estructural.
Por
Eric Martz, University of Massachusetts, July 2003 (revised February 2004)
Agradecimientos a Byron Rubin por algunos aspectos tratados.
Lecturas adicionales:
- TargetDB mantenido por
RCSB, puede ser preguntado según Status para averiguar el número actual de objetivos
que se han alcanzado en cada etapa. Aproximadamente el 25% de los resultados completados están siendo obtenidos por RMN.
-
Structural genomics takes off, Thornton,
Trends Biochem. Sci., 26:88, 2001.
- Structural
genomics. Tapping DNA for structures produces a trickle,
Service, Science 298:948, 2002.
- Structural
genomics: current progress, Gerstein et al.,
Science 299:1663, 2003.
Los autores puntualizan que el progreso global es superior al número de estructuras resueltas, puesto que cada una sirve como modelo para el modelaje por homología respecto a a un gran número de familias de secuencias. Con frecuencia también, el trabajo se detiene respecto a un objetivo cuando otro objetivo con secuencia relacionada se resuelve; de forma que no todos los objetivos incompletos son fallos.
