¡Qué porcentaje del proteoma humano posee estructura conocida?
- ~40.000 genes en el genoma humano.
- ¡"Conocidos"?
Las compañías farmaceúticas resuelven un gran número de estructuras pero la mayoría no están depositadas en el Protein Data Bank.
- ~25.000 entradas en el Protein Data Bank:
- ~5.600
secuencias distintas de buena calidad.
- ~1.100 de ellas son
humanas.
- La mayoría de estas entradas corresponden solo a dominios o a fragmentos de proteínas.
Respuesta (experimental):
~1%
Respuesta (modelaje por homología): ~20% de los dominios, es decir
~10% de todas las proteínas?
Solución: Genómica estructural?
Por
Eric Martz, University of Massachusetts, Julio 2003 (revisado Febrero 2004)