Variantes estructurales del DNA en doble hebra: Formas A y Z


A-DNA:
La forma A es una doble hélice, dextrógira como la B, pero más ancha. La línea verde, ficticia, une los átomos de fósforo (es decir, define el esqueleto): obsérvese la helicoicidad.
Obsérvese también la inclinación de los pares de bases, mayor que en el B-DNA.

Vista axial:       Para verlo mejor:
1º) parar la rotación;    ¿cómo?
2º) pulsar aquí

Obsérvese que los pares de bases se sitúan a un lado del eje de la hélice; por ello, la hélice es más ancha.

3º) antes de seguir, activar de nuevo la rotación    ¿cómo?

Modelo espacial compacto (bases y esqueleto)
Lo que era el surco mayor en el B-DNA se convierte en la foma A en un surco estrecho y profundo, mientras que el surco menor es ancho y superficial.


Z-DNA:
La forma Z es una doble hélice levógira, lo que la diferencia de las A y B, y es más estrecha. Obsérvese cómo el esqueleto (línea verde, ficticia, que une los átomos de fósforo) avanza en sentido levógiro y además describe una línea en zig-zag. Esta característica da nombre a la forma Z.

Vista axial:       Para verlo mejor:
1º) parar la rotación;    ¿cómo?
2º) pulsar aquí

3º) antes de seguir, activar de nuevo la rotación    ¿cómo?

Modelo espacial compacto (bases y esqueleto)
Lo que era el surco mayor en el B-DNA se convierte en la foma Z en un surco muy poco profundo, mientras que el surco menor es estrecho y profundo.

El origen de la distinta conformación del Z-DNA se encuentra en la orientación diferente de los enlaces N-glicosídicos:  En los nucleótidos purínicos (A, G) la base se sitúa sobre el anillo de pentosa (conformación sin), mientras que en los pirimidínicos (T, C) se sitúa hacia fuera (conformación anti). En las formas A y B del DNA, todos los nucleótidos están en conformación anti:

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Comparación entre las formas A, B y Z:

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