Motivo
hélice-giro-hélice
(también llamado hélice-vuelta-hélice)
Ejemplo 1
Dímero de la proteína Cro del
bacteriófago lambda; se muestra sólo una parte de la proteína,
la que corresponde a sus dos motivos hélice-giro-hélice,
unida a un fragmento de DNA de 20 pb.
Cada cadena se muestra en un color: las 2
hebras de DNA y
2 motivos en la proteína
dimérica.
Para apreciar mejor la estructura tridimensional,
es conveniente girar la molécula (usando el botón izquierdo
del ratón: pulsar y arrastrar).
La
estructura que es común con otras proteínas, y por ello se
llama motivo, consta de:
1) un tramo en alfa-hélice, que encaja
en el surco mayor del DNA e interacciona directamente con las bases nitrogenadas,
llamado por ello "hélice de reconocimiento";
2) un corto tramo de péptido sin estructura
secundaria (un giro o vuelta,
en inglés turn);
3) otra alfa-hélice
que queda más separada del DNA y forma un ángulo fijo con
la primera.
Estos tres componentes dan nombre al motivo. Además de ellos, cada
proteína en particular posee otras regiones
en alfa-hélice, giros y bucles
que colaboran en la estructura del motivo, y el resto de la molécula
de proteína, no mostrada.
Modelo espacial compacto
Otro ejemplo de proteína con dos motivos hélice-giro
hélice
"Represor lambda", proteína del bacteriófago
lambda, unido al DNA en la región del operador.