La proteína se asocia establemente al DNA mediante enlaces no covalentes a lo largo de todo el DNA. La disposición de los dos monómeros es simétrica.

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Esqueleto en forma de trazo grueso:
      Subunidad A de Gal4,
      Hebra 1 del DNA,
      Hebra 2 del DNA.

+ la subunidad B de Gal4
      (posición especular)

+ residuos laterales de aminoácidos
      + pares de bases del DNA

Sólo la proteína,
      los colores siguen significando lo mismo.

Residuos hidrofóbicos,
      Residuos hidrofílicos,
      Esqueleto del monómero A,
      Esqueleto del monómero B.

Utiliza en el menú la elección Options -> Slab mode para visualizar los trozos hidrofóbicos entre las hélices anfipáticas. Para cambiar el plano de corte (slab), pincha sobre la imagen manteniendo pulsada la techa Control (tanto en mac como en PC).
Volviendo a selecionar el menú Options -> Slab mode se desactiva el modo de visualización de cortes.