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Comités
de
nomenclatura bioquímica [IUPAC-IUBMB]
1
y
2
.
Tutor
de Química [The Biology Project, Univ. Arizona].
Bases
de química para entender las estructuras biomoleculares; enlaces
químicos y fuerzas de unión; química del agua; una
introducción a las moléculas orgánicas.
Ejercicios
del Tutor de Química [The Biology Project, Univ. Arizona].
Ejercicios
guiados para comprender las propiedades químicas de los elementos
que forman las biomoléculas y los enlaces que las conforman; la
importancia de las propiedades del agua en el mantenimiento de estas estructuras;
la importancia de las reacciones red-ox en biología; la solubilidad
de los lípidos y la presencia de isótopos.
Ejercicios
de Moléculas Grandes [The Biology Project, Univ. Arizona].Ejercicios
guiados para aprender a identificar las biomoléculas, reconocer
los enlaces que las conforman y los que colaboran en la unión de
monómeros para la formación de macromoléculas y polímeros
biológicos, especialmente péptidos y proteínas.
Estereoquímica
[Colby College, Maine]. Ejercicios para entender los conceptos
quiral, aquiral, meso, enantiómeros, diastereómeros,...
Estructura
y propiedades del agua líquida
[Martin Chaplin, London South Bank Univ.]. Incluye hidrocoloides,
entre ellos agar, alginato, arabinoxilano, carragenano, celulosa, gelatina,
glucano, goma arábiga, goma guar, pectina, almidón, goma
xantano...
su metabolismo![]() |
Estructura
y función de los glúcidos; incluye ejercicios [Aula
Virtual, Univ. Murcia]
Estructura
y función del glucógeno [Enrique Villar, Univ.
Salamanca]
Visor
de monosacáridos. [J.Maber, Univ. Leeds, U.K.] Fórmulas
de Fischer con modelos moleculares compactos de todos los monosacáridos;
se puede obtener el nombre seleccionando la estructura y viceversa; se
puede seleccionar por aldosa/cetosa, 3 ó 6 átomos de carbono
y cambiar la quiralidad de cualquiera de los átomos. Dibujo animado
que muestra cómo se obtienen las proyecciones de Fischer a partir
del modelo tridimensional.
Examen
de carbohidratos y lípidos [Uniformed Services University]
Estructura
de glúcidos [KUMC Medical Biochemistry;
Univ. of Kansas Medical Center] presentación en diapositivas-web
Recopilación
de recursos web [Science] Carbohydrate
Chemistry & Glycobiology
Nomenclatura
de glúcidos
[IUPAC/IUBMB]:
Recomendaciones
Estructura
y función de polisacáridos [Biochemistry
BCHM 331; Dr. Henry Jakubowski, CSB/SJU]
La
estructura correcta del glucógeno
y errores en los libros de texto
Estructura
de hidrocoloides, entre ellos agar,
alginato, arabinoxilano, carragenano, celulosa, gelatina, glucano, goma
arábiga, goma guar, pectina, almidón, goma xantano...
Hidratación de polisacáridos. ["Estructura y propiedades
del agua líquida", Martin Chaplin, London South Bank Univ.].
su metabolismo![]() ![]() |
Estructura
y función de los lípidos; incluye ejercicios [Aula
Virtual, Univ. Murcia]
Los
aceites de oliva, tipos y características: divulgativo, no bioquímico
[Javier Melgares]. Muy completo
Conceptos básicos de lípidos. Lipoproteínas y su metabolismo.
[Tomás Valdés González]
Examen
de carbohidratos y lípidos [Uniformed Services University]
The
World of Membrane Lipids [Lesa Beamer, Univ. Missouri-Columbia]
Lipoproteínas:
véase Metabolismo de lípidos
Transporte
a través de membrana y
canales
iónicos [A.L. García Villalón, Univ. Autónoma
de Madrid]. Incluye simulación de potencial transmembrana.
su metabolismo![]() |
Estrucutura
y propiedades [Institute of Chemistry, Dept. Biology, Chemistry, Pharmacy,
Freie Universität Berlin]. Nombre, abreviaturas de 3
y 1 letra, fórmula molecular, lineal y tridimensional, modelo molecular
interactivo, masa molecular, punto isoeléctrico.
Información
de aminoácidos [R.C.Beavis & D.Fenyo], dentro de un curso de
modelado mediante homología [G.Vriend, BioComputing Unit, EMBL].
Estructura
química, modificaciones postraduccionales, grupos protectores, accesibilidad
al disolvente, clasificaciones químicas, escalas de hidrofobicidad,
volumen y área de la molécula, pKa, solubilidad, densidad,
pI, enlaces de hidrógeno, geometría del enlace peptídico.
Identificación
de aminoácidos, con las moléculas en
2D
o en
3D.
Otro
examen de identificación de aminoácidos [Univ. Estocolmo]
Estructura
[John Kirk] Interactivo.
Estructura
comentada y acompañada con modelos moleculares [N. Boxall, J. Tweedie,
Massey Univ., Nueva Zelanda]:
Principios
de estructura de proteínas usando internet: estructura
primaria - los aminoácidos [Birkbeck College]. Muy completo.
Estructura![]() |
Función, propiedades, aislamiento![]() |
Su metabolismo![]() |
Estrutura, função e diversidade das imunoglobulinas [Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brasil].
O Anticorpo: Estrutura da Molécula de Imunoglobulina [Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Brasil].
La
Estructura de las Proteínas [Rogelio Rodríguez-Sotres,
Univ. Nacional Autónoma de México]. Aminoácidos;
Enlace peptídico; Anatomía de una proteína; Fuerzas
básicas; Estructura secundaria; Estructura supersecundaria; Dominios;
Estructura terciaria; Estructura cuaternaria.
Muy amplio. Ilustrado con preguntas y respuestas interactivas {requiere
Java}.
Estructura
comentada y acompañada con modelos moleculares [N. Boxall, J. Tweedie,
Massey Univ., Nueva Zelanda]:
Estructura
y función de proteínas, pH y pK [Uniformed Services
University]
Principios
de estructura de proteínas usando internet [Birkbeck
College]: recopila material de varios autores y enlaces a páginas
ajenas; bastante extenso. Estructura primaria; Geometría
de las proteínas; Fuerzas moleculares y estructura de las proteínas;
Estructura secundaria; Estructura terciaria; Estructura cuaternaria; Interacción
entre proteínas.
Introducción
a las proteínas [en The Molecules
of Life, Univ. Oxford]: para qué sirven, cómo
se forman y cómo es su estructura.
ProTeach:
curso de estructura de proteínas de Protein Society {emplea el programa
Mage,
que se puede descargar desde allí}. El enlace
ha dejado de funcionar.
Protein
Spotlight: revista electrónica del grupo SWISS-PROT,
Instituto Suizo de Bioinformática, acceso gratuito. Publica mensualemente
un artículo sobre una proteína interesante, en clave informal.
Parece una buena fuente para seminarios o trabajos.
Proteínas
globulares y fibrosas (S.J. Perkins, Univ. Central London).
Formatos
PowerPoint y PDF
Colágeno,
elastina, entrecruzamientos en ellos y prolina oxidasa [Joni Mäki,
publicación electrónica de la Univ. de Oulu, Finlandia]
...
su metabolismo![]() |
...
Estructura
y función de los ácidos nucleicos; incluye ejercicios
[Aula Virtual, Univ. Murcia]
Examen
de identificación de nucleótidos, con las moléculas
en
2D
o en
3D
(para
3D se necesita el programa Chime).
Examen
de ácidos nucleicos [Uniformed Services University]
Bases,
nucleósidos, nucleótidos y cadenas polinucleotídicas
[Biochemistry 3107, Martin E. Mulligan,
Memorial University of Newfoundland, Canadá]
Introducción
a los ácidos nucleicos [en The
Molecules of Life, Univ. Oxford].
Centro
del genoma humano en la web de Nature. Índice de los
cromosomas secuenciados, artículos gratuitos, enlaces...
Construye
una molécula de ADN: actividad de construción
de un DNA bicatenario a partir de nucleótidos, aplicando el emparejamiento
de bases [Genetic Science Learning Center, Univ. of Utah].
Artículo
de Watson y Crick que proponía la estructura en doble hélice
para el DNA (Nature, 1953):
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Estructura
del DNA: Aspectos básicos [John Kirk]. Interactivo, en etapas.
Estructura
de la molécula de DNA [Access Excellence]. Aspectos
históricos, figuras, prácticas, glosario.
DNA
de la A a la Z: aplicaciones del DNA, biológicas, químicas
y físicas, algunas casi en broma. También ordenadores basados
en DNA, y puedes escribir un mensaje y enviarlo codificado por correo electrónico
usando el código genético (un "DNAgrama"). (Tu
mensaje se interpreta como una secuencia de aminoácidos y se traduce
a la inversa con el código genético dando una secuencia de
nucleótidos, que es la que se envía)
Estructura
del B-DNA [Biochemistry 3107, Martin
E. Mulligan, Memorial University of Newfoundland, Canadá]
Variaciones
estructurales de DNA y RNA [Biochemistry 3107,
Martin E. Mulligan, Memorial University of Newfoundland, Canadá]
Tramos
poli(A), palíndromos, horquillas, pseudonudos, cruciformes, A-DNA,
Z-DNA, pares de basese de Hoogsteen, H-DNA.
Estructura
del DNA [DNA from the beginning]: Cómo
se dedujo la estructura de la doble hélice. Presentación
en etapas. La molécula de DNA tiene forma de escalera
retorcida. Modelo de Watson y Crick. Reglas de Chargaff. Difracción
de rX. Muy bueno
Estrutura
do DNA [Galeria de Moléculas, Univ. Federal do Rio Grande do Sul,
Brasil]. Dupla hélice, pareamento de bases e
pontes de hidrogênio. O código genético e a replicação
do DNA. A estrutura das fitas e a "espinha" de fosfato/desoxi-ribose. As
extremidades 5' e 3', antiparalelismo das fitas.
...
...
Página
de Michael Zuker, dedicada principalmente al plegamiento del RNA (nivel
avanzado, investigación). Termodinámica, software,
bases de datos.
Estructura
y función del tRNA (BioSci 99A)[Dr.
H. Luecke, Univ. California Irvine]
...
Trabajo
sobre la topoisomerasa I y su actividad proteína quinasa [Laurent
Gauthier]
Superenrollamiento
y topoisomerasas [Biochemistry 3107,
Martin E. Mulligan, Memorial University of Newfoundland, Canadá]
Cinética
Enzimática en Imágenes [Rogelio Rodríguez-Sotres,
Univ. Nacional Autónoma de México].
Problemas
sobre enzimas [Rogelio Rodríguez-Sotres, Univ. Nacional Autónoma
de México].
Las
enzimas: información básica [Rubén Hernández
Gil, Univ. de Los Andes, Mérida, Venezuela]
Apuntes
de enzimas y cinética enzimática [José Ramón
Martín Solís, Depto. de Física, Univ. Carlos III de
Madrid].
Enzymes
I and II: sitio web del libro virtual Concepts
in Biochemistry, de R.Boyer (presentación de tipo diapositivas
con las ideas clave del tema).
Mini-curso
de cinética enzimática en Thomas Jefferson Univ.
Nomenclatura
de las enzimas [IUBMB]: nombres recomendados y código
EC.
Nomenclatura
de enzimas [EMP Project]:
clasificadas por código EC; además del nombre recomendado,
reacciones catalizadas, varios datos y referencias bibliográficas.
Búsqueda
de enzimas en la base de datos EC, con enlaces a OMIM y SWISS-PROT [Dan
Jacobson, Johns Hopkins University].
[University
College London].
Enzyme
Structures Database: estructuras conocidas existentes en la
colección PDB, clasificadas según E.C. [University College
London].
Bioquímica
de las enzimas en el MIT's Biology Hypertextbook:
Energía
de las reacciones químicas; Mecanismos enzimáticos; Cinética
enzimática de M-M; Inhibición;
Problemas resueltos;
Retroinhibición; Problemas resueltos.
Problemas para practicar,
con soluciones.
Enzyme
Tutorials [BioG 101-104 Course, Cornell University] Preguntas
autoevaluadas
Estructuras
de ribozimas en la base de datos NDB (archivos pdb y gif).
Ribozyme
Jump Station: colección de enlaces relativos a las ribozimas.
Vitaminas;
incluye ejercicios [Aula Virtual, Univ. Murcia]
Página
web de Vitaminas de Univ. Miguel Hernández [Gines Rosa Bermejo y
Juan Francisco Moreno Labanda]
Fórmulas
de coenzimas en 2 y 3 dimensiones: ATP, CoA, FAD, NAD+, NADP+
[Karl J. Miller, George Washington Univ.]
Ejercicios
de vitamina B12 y folato [The Biology Project,
Univ. Arizona]. Ejercicios guiados que ayudan a estudiar
la función de estas dos vitaminas, en qué reacciones intervienen;
las consecuencias de su deficiencia, y las reacciones metabólicas
en las que confluyen ambas estructuras.
Vitamina
B1 [Glactone, Univ. Georgia]: Historia,
Función bioquímica, Enfermedades por deficiencia, Estructuras,
Bibliografía y Enlaces.
Nociones
generales del metabolismo [E. Villar, Univ. Salamanca]
Metabolismo (esquemas de clase) [Univ. Salamanca]
Material de apoyo de Bioquímica Estructural y Metabólica (esquemas de clase) [J. León, Univ. Cantabria]
Mapas
metabólicos de Roche Molecular Biochemicals (antes Boehringer Mannheim)
(versión digitalizada en el servidor ExPASy en Suiza):
Pág. principal y búsqueda por palabras clave.
"Biochemical Pathways - Metabolic Pathways" Mapa con acceso por cuadrículas, a color, con enlace a la información de las enzimas. Organizado por rutas metabólicas.
"Biochemical Pathways - Cell and Molecular Processes" Mapa con acceso por cuadrículas, a color, con enlace a la información de las enzimas. Organizado por ubicación celular.
"HordeNet"
Major Metabolic Pathways [Univ. Akron, EE.UU.]
Mapas
metabólicos de KEGG [Kyoto Encyclopedia of Genes and
Genomes, en Kyoto Univ., Japón] (Hay réplica
en Weizmann Institute of Science, Israel
,
pero no funciona bien): genéricos y específicos de
distintos organismos. Se incluyen instrucciones de uso, búsqueda,
enlaces a bases de datos...
EcoCyc/MetaCyc
Pathway Tools [Encyclopedia of E. coli Genes and Metabolism
& Metabolic Encyclopedia]: Esquema general de todas las rutas metabólicas
de Escherichia coli y otros organismos.
Se puede pulsar
en cada una para obtener información de la ruta, las enzimas, etc.
También se puede buscar por proteína, ruta, reacción,
compuesto o gen.
Biopsicología.Net:
Rutas metabólicas relacionadas con la actividad cerebral.
Integración
del metabolismo [KUMC Medical Biochemistry;
Univ. of Kansas Medical Center] presentación en diapositivas-web
Búsqueda
en rutas metabólicas [EMP Project]
Rutas
metabólicas [Biocarta]:
Descripción,
esquema gráfico, hiperenlaces. Búsqueda de productos comerciales.
Enlace a bases de datos moleculares. No sólo metabolismo,
también rutas de transmisión de señal, interacciones
moleculares...
Mapas
metabólicos de Donald Nicholson e IUBMB (Metabolic mini-maps)
Aspectos
básicos de oxidación - reducción [Alfonso Martínez-Conde
y Pilar Mayor, Univ.Complutense de Madrid]
su estructura![]() |
Metabolismo
de glúcidos [KUMC Medical Biochemistry;
Univ. of Kansas Medical Center] presentación en diapositivas-web:
Glucólisis. Transporte electrónico y Fosforilación
oxidativa. Ruta de las pentosas fosfato. Ciclo de los ácidos tricarboxílicos.
Metabolismo del glucógeno. Glicoproteínas y proteoglicanos.
Digestión y absorción de glúcidos de la dieta
Glucólisis
Regulación de la glucólisis
Entrada de otros monosacáridos
Diagrama
con visión general y
más
detallada [Robert J. Huskey, Univ. Virginia]
Esquema
general;
detalles,
parte 1;
detalles,
parte 2 [Access Excellence]
Esquema
de la ruta con enlaces a información de metabolitos y enzimas [Univ.
Indiana]
Reacciones
y estructuras en 2 y 3 dimensiones [Karl J. Miller, George Washington Univ.].
Valores
de cambio de energía libre (
G°')
de cada reacción.
Glucólisis
en modelos moleculares del Dr. William McClure [Molecular Models
for Biochemistry, Carnegie Mellon Univ.].
Animación
de la glucólisis [MicroWeb, BioMi290/91, Cornell Univ.]
con énfasis en lo que le ocurre a las moléculas, tipo de
reacción y balance energético.
Glucólisis
en esquemas animados [John Kirk, Cell Biology Animation] Muy
vistoso y completo. Combina fórmulas, modelos, movimiento, balance
energético.
Fermentaciones
láctica y alcohólica [Enrique Villar, Univ. Salamanca]
Metabolismo
anaeróbico del piruvato: fermentaciones láctica y alcohólica
[Access Excellence]. Esquema gráfico de mabs rutas
(figs. del libro de Alberts), se puede descargar pdf.
Animación
de la fermentación [MicroWeb, BioMi290/91, Cornell Univ.]
con énfasis en lo que le ocurre a las moléculas, tipo de
reacción y balance energético.
Estructuras
en 2 y 3 dimensiones y reacciones [Karl J. Miller, George Washington
Univ.]
Esquema
de la ruta [Hagai Ginsburg, Hebrew Univ.]
Mapa
metabólico en Escherichia coli y en otros organismos [Kyoto
Encyclopedia of Genes and Genomes]
Ciclo
del ácido cítrico y
su
regulación [Enrique Villar, Univ. Salamanca].
Paso
a paso, en forma de fichas: descripción, reacción y animación
para cada etapa. [J. Maber, Univ. Leeds, U.K.]
Ciclo
de Krebs con animación [Robert J. Huskey, Univ. Virginia]
Esquema
general del ciclo; detalles y reacciones:
1ª
parte (reacciones 1-2) y
2ª
parte (reacciones 3-8) [Access Excellence]
Reacciones
y estructuras en 2 y 3 dimensiones [Karl J. Miller, George Washington Univ.].
Valores
de cambio de energía libre (
G°')
de cada reacción.
Ciclo
de Krebs en modelos moleculares del Dr. William McClure [Molecular Models
for
Biochemistry, Carnegie Mellon Univ.].
Ciclo
de Krebs en esquemas animados [John Kirk, Cell Biology Animation].
Muy vistoso y completo. Combina fórmulas, modelos, movimiento, balance
energético.
Fosforilación
oxidativa [Enrique Villar, Univ. Salamanca]
Transporte
electrónico [Robert J. Huskey, Univ. Virginia]
Animación
del transporte electrónico y la fosforilación oxidativa[MicroWeb,
BioMi290/91, Cornell Univ.].
Fosforilación
oxidativa [Karl J. Miller, George Washington Univ.]
Mitocondria
y transporte electrónico en esquemas animados [John Kirk,
Cell Biology Animation] Muy vistoso y completo.
Reacciones
y estructuras en 2 y 3 dimensiones [Karl J. Miller, George Washington Univ.].
Valores
de cambio de energía libre (
G°')
de cada reacción.
Biosíntesis
del glucógeno y ruta de la galactosa; reacciones y estructuras en
2 y 3 dimensiones [Karl J. Miller, George Washington Univ.]
Metabolismo
del glucógeno: introducción, síntesis, degradación
y regulación de ambas, enfermedades del almacenamiento de glucógeno
[THCME Medical Biochemistry page, Michael
W. King, Indiana Univ.]. Muy completo, texto y figuras.
Fosforilación
fotosintética [Enrique Villar, Univ. Salamanca]
Ciclo
de Calvin [Access Excellence]
Animaciones de la fotosíntesis
en
ausencia y
en
presencia de oxígeno [MicroWeb, BioMi290/91, Cornell
Univ.].
Fotosíntesis en esquemas animados
1
y
2.
[John Kirk, Cell Biology Animation] Muy vistoso y completo. Combina fórmulas,
modelos, movimiento, balance energético.
su estructura![]() |
Lipoproteínas
y su metabolismo. [Tomás Valdés González]
Dislipidemias
[Fernando Carrasco, Univ.de Chile]. Presentación de PowerPoint.
Beta-oxidación
de ácidos grasos [Knowledge Weavers, Univ. Utah].
Reacciones
y estructuras en 2 y 3 dimensiones [Karl J. Miller, George Washington Univ.]:
Metabolismo
de lípidos [KUMC Medical Biochemistry;
Univ. of Kansas Medical Center] (Bueno)Presentación
en diapositivas-web:
Oxidación de ácidos grasos y cuerpos cetónicos.
Síntesis de ácidos grasos. Metabolismo de glicerofosfolípidos
y esfingolípidos. Utilización de triacilgliceroles. Alteraciones
del metabolismode lípidos: obesidad y diabetes mellitus. Metabolismo
del colesterol y otros poliisoprenos. Lipoproteínas plasmáticas.
Aspectos bioquímicos de la enfermedad cardiovascular.
Reacciones
y estructuras en 2 y 3 dimensiones [Karl J. Miller, George Washington Univ.]:
BioSci 99A [Dr. H. Luecke, Univ. California Irvine]:
lección nº 7: Procesamiento postraduccional. Modificaciones covalentes, modificaciones de la cadena lateral, glicosilación, procesamiento proteolítico, modificaciones no covalentes, plegamiento, carabinas, selenocisteína.
lección nº 8: Tráfico y dirección. Dirección en procariotas: secreción. Dirección en eucariotas: citoplasma, núcleo, mitocondria, lisosoma, ruta secretora, degradación dirigida de proteínas.
Biochemistry
3107 [Martin E. Mulligan, Memorial University of Newfoundland,
Canadá]. Texto y figuras; recomendable:
Plegamiento, modificación, dirección y degradación.
Páginas
web de proteoglicanos y glicosaminoglicanos [Bob Lauder, Lancaster Univ,
U.K.]
Defectos
congénitos de glicosilación [Univ. Leuven, Bélgica]
"Desentrañando
el misterio del plegamiento de proteínas" [W.A. Thomasson,
FASEB]. Divulgativo; introducción con ejemplos de enfermedades. También
en pdf
.
Introducción
al plegamiento de proteínas [en
The
Molecules of Life, Univ. Oxford]
Transporte
hacia y desde el núcleo [Virtual Biology; Seoulin Bioscience,
Corea]. Muy bueno. Explicaciones y animaciones.
Proteolisis
dependiente de ubicuitina [Harvard Medical School]. Desarrollo
extenso del tema. Sitio complementario al libro de Peters,
Harris y Finley. Incluye también estructuras moleculares, enlaces
a bases de datos, a software, a sitios de proteasas y a revistas.
Metabolismo de las purinas
Metabolismo de las pirimidinas
...
Apuntes
sobre Biología Molecular [Edgar Vázquez-Contreras,
Univ. Autónoma de México]. Introducción;
Descubrimiento del ADN; El ADN es el material genético universal;
Los componentes del ADN; El ADN es una doble hélice; Estructura
de los cromosomas; Replicación del ADN; Transcripción; Genoma
humano; Traducción.
Dogma
central de la genética [MicroWeb, BioMi290/91, Cornell
Univ.].
La
estructura de un gen: actividad que muestra y explica las distintas
zonas que componen un gen: codones de inicio y parada, intrones y exones,
etc. [NOVA Online].
Dogma
central de la genética: cómo se produce el flujo
de información genética en los seres vivos, ilustrado con
el gen de la luciferasa (enzima responsable del brillo de las luciérnagas)
[Genetic Science Learning Center, Univ. of Utah].
Ejercicio
de complementariedad [WGBH, Boston, EE.UU.A.].
Replicación
del DNA [John Kirk]: Aspectos básicos. Dibujo animado interactivo,
en etapas.
Replicación
[Yvette Petty, New Century College at George Mason University]: descripción
y
John
Kimball's Biology Pages: velocidad de replicación en
pro- y eucariotas, control positivo y negativo.
Biochemistry
3107 [Martin E. Mulligan, Memorial University of Newfoundland,
Canadá] Texto y figuras; recomendable:
Replicación
Enzimología de la síntesis de DNA
El proceso de replicación
Replicación eucariótica
Telomere
Club: Colección de recursos relativos a telómeros
y telomerasa, de Toru M. Nakamura [Univ. Colorado]
DNA
polymerase, molecule of the month [David S. Goodsell y Protein
Data Bank] DNApol de Thermus aquaticus.
Experimento
de Meselson y Stahl [W.H.Freeman]. En este experimento biológico
clásico, se utilizó la centrifugación en un gradiente
de densidad de CsCl para demostrar que la replicación del DNA tenía
lugar de forma semiconservadora.
...
Transcribe
y traduce un gen: actividad de conversión de una secuencia
de DNA en RNA, y éste en una cadena polipeptídica [Genetic
Science Learning Center, Univ. of Utah]. Tiene
errores de traducción al español.
Transcripción
[John Kirk]: Aspectos básicos. Interactivo y en etapas.
Transcripción
[Yvette Petty, New Century College at George Mason University]: descripción
y
.
Biochemistry
3107 [Martin E. Mulligan, Memorial University of Newfoundland,
Canadá] Texto y figuras; recomendable:
Transcripción en bacterias: introducción
La RNA polimerasa bacteriana
El promotor bacteriano
El ciclo de transcripción en E. coli
Transcripción eucariótica
Proteínas ligantes de DNA
Transcripción
- Tutorials in Molecular Biology [University of California,
Los Angeles].
TRANSFAC:
Base de datos de Factores de Transcripción; clasificación
(Research Group Bioinformatics, Bélgica). Especializado
Etapas
de la transcripción en procariotas, paso a paso [MicroWeb,
BioMi290/91, Cornell Univ.].
RNA
polymerase, molecule of the month [David S. Goodsell y Protein
Data Bank] RNApol de levadura.
Biochemistry
3107 [Martin E. Mulligan, Memorial University of Newfoundland,
Canadá] Texto y figuras; recomendable:
Intrones
Ayuste (corte y empalme)
Modificaciones del mRNA eucariótico. Edición de nucleótidos, Caperuza 5',Cola 3' poli(A); Eliminación o adición de nucleótidos en 5' o en 3'
Ayuste
- Tutorials in Molecular Biology [University of California,
Los Angeles].
Ayustosoma
[Neuromuscular Disease Center, Washington University]. snRNP
componentes, papel funcional. Patologías asociadas. Dibujos animados
de la actuación del ayustosoma.
Bioquímica
del ayuste de los pre-mRNAs [ZYGOTE, a website for Developmental
Biology, Scott Gilbert, Swarthmore College, Swarthmore, PA, USA].
Ayuste
nuclear del pre-mRNA [curso Biology
115: Eukaryotic Molecular Biology, Grant Hartzog, Univ. California
at Santa Cruz]. Notas (formatos Word
y pdf), película con el ensamblado
del ayustosoma y su actuación sobre el RNA, película con
el mecanismo de la reacción (
).
The
RNA modification database - a comprehensive listing of post-transcriptionally
modified nucleosides from RNA. A total
of 96 modified nucleosides for which structures have been assigned have
been reported in RNA (81 are found in tRNA, 30 in rRNA, 12 in mRNA and
13 in other RNA species, most notably snRNA).
Transcribe
y traduce un gen: actividad de conversión de una secuencia
de DNA en RNA, y éste en una cadena polipeptídica [Genetic
Science Learning Center, Univ. of Utah]. Tiene
errores de traducción al español.
Variaciones
del código genético en diversos organismos.
Traducción
[Yvette Petty, New Century College at George Mason University]:
El código genético
Iniciación, elongación y terminación
Problema
BioSci 99A [Dr. H. Luecke, Univ. California Irvine]:
lección nº 1: Dogma central y descifrado del código genético. Traducción, evidencia experimental para el descifrado del código.
lección nº 2: Estructura y función del tRNA. tRNA, aminoacil-tRNA sintetasas, balanceo.
lección nº 3: Ribosoma, rRNA y mRNA. Composición del ribosoma, vista general de la traducción, estructura tridimensional del ribosoma.
lección nº 4: Síntesis de polipéptidos I. Visión general, iniciación en procariotas y eucariotas.
lección nº 5: Síntesis de polipéptidos II. Elongación y terminación.
lección nº 6: Regulación de la traducción. Geometría de los factores de elongación procarióticos, velocidad y energética de la traducción, corrección de errores, regulación en procariotas y eucariotas, inhibición por antibióticos.
El código genético
tRNA y las hipótesis adaptadora y del balanceo
Ingredientes para la síntesis de proteínas. Aminoacil-tRNAs, Ribosomas, mRNA, Factores proteicos auxiliares, tRNA iniciador.
Las 9 etepas en la síntesis de proteínas. Iniciación, elongación, desensamblado, terminación, antibióticos. Traducción en eucariotas. Coordinación con la síntesis de mRNA.
Progreso
de la traducción [curso Bio23,
Tom Jack y Bob Gross, Dartmouth College, Hanover, NH, USA]. Avance
del ribosoma sobre el mRNA, unión de factores proteicos y de tRNAs
(procariotas).
Aminoacil-tRNA
sintetasas. Artículo en Nucleic Acid
Research, posiblemente el acceso esté limitado a suscriptores.
Comentario sobre estas enzimas y la base de datos de sintetasas AARSDB.
Protein
Synthesis: Seminar I-II [Wayne State Univ.]. Interesante especialmente
para los aspectos evolutivos en torno a las aminoacil-tRNA sintetasas.
Síntesis
de proteínas [TCHME Medical
Biochemistry Page, Michael W. King, Indiana State Univ.] Introducción,
historia; Código genético; tRNAs; etapas; regulación.
Etapas
de la traducción en procariotas, paso a paso [MicroWeb,
BioMi290/91, Cornell Univ.].
(La maduración postraduccional está en la sección Metabolismo de proteínas )
Immunobiology
- MCDB 133 [Duane W. Sears, Univ. of California Santa Barbara].
Curso muy completo (utilizad el menú desplegable de
la parte superior); entre otras cosas:
Estructura Tridimensional de Moléculas Inmunológicas
John
Kimball's Biology Pages: definición, mecanismos, relación
con cáncer, SIDA y transplantes.
Apoptosis:
danza de la muerte [Cells Alive]. Imágenes al microscopio.
The
Apoptopedia: glosario de términos relacionados con la
apoptosis.
Upstate
Biotechnology Apoptosis Pathways: figuras interactivas para
investigar las rutas implicadas.
Sitio
web de apoptosis de Boehringer-Mannheim / Roche
Molecular Biochemicals: póster y diagrama interactivo
de las rutas, presentación en diapositivas (descargable), referencias,
enlaces, datos de productos...
Muerte
celular activa [Biology 458; Chris McBride, Canadá] Formas
de muerte celular activa o programada: apoptosis, autofagia, desintegración
no lisosómica, citoplásmica. Genes ced. Bcl-2. Caspasas.
IAPs. Mitocondria.
Apoptosis,
Radiosensitivity and the Cell Cycle [Dr. McKenna, Univ. Pennsylvania].
Extenso,
sólo texto.
Apoptosis
inducida por glucocorticoides [John Moose y grupo del Dr. John
Stevenson, Miami University, Oxford, OH, USA]. Texto, figuras
y animaciones (
). Receptor de
glucocorticoides; Ruptura de las mitocondrias; Activación de caspasas.
Enlaces.
Apoptosis
en Cancer - an encyclopedic reference.
Tema
resumido de apoptosis [S. Nagata; Cancer - an encyclopedic reference; Springer].
Colección
de enlaces de apoptosis. [The WWW Virtual Library of Cell Biology].
Sociedad
Internacional de Bioética (SIBI)
Declaración Bioética de Gijón, 2000
Quimioterapia
- Fármacos antitumorales: clasificación, mecanismo de acción,
estructura [M.Gordon, Univ. Kansas, EEUU].
El
Proyecto Biológico [Univ. Arizona] (Resumido)
Lo
básico del DNA. Ciclo celular y regulación. Mitosis, con
una animación (
).
Problemas de autoevaluación (
).
Hipertextos
de Biología [Univ. Nacional del Nordeste, Rep.
Argentina]. Ciclo celular, mitosis, meiosis.
Prolijo;
con enlaces.
John
Kimball's Biology Pages: etapas, control, proteína p53
, fase G0.
Virtual
Biology [Seoulin Bioscience, Corea] Muy
bueno. Explicaciones y animaciones.
Milestones
in Cell Division [Nature WebFocus] Serie especial
de artículos con los principales avances históricos en el
tema. Acceso libre.
Clonación
posicional y mapeo de genes [KUMC Medical
Biochemistry; Univ. of Kansas Medical Center]: presentación
en diapositivas-web o descarga de archivo PowerPoint
Genetics
at Vanderbilt [Vanderbilt Genetic Institute]:
Errores congénitos del metabolismo [Dr. Marshall Summar]
Human Genetic Toolbox:
Polimorfismos: definiciones breves y algunos enlaces
Análisis de ligamiento
Métodos de detección de mutaciones
Bases
moleculares de la enfermedad humana [KUMC Medical
Biochemistry; Univ. of Kansas Medical Center] presentación
en diapositivas-web o descarga del archivo PowerPoint:
Alelos, recombinación y ligamiento
Polimorfismos y RFLPs
Base molecular de las enfermedades genéticas
Información
general sobre enfermedades genéticas [Human Genome Project Information].
Estructura
e información de la proteína priónica [en HotMolecBase,
Weizmann Institute of Science, Israel]. Estructura; Modificaciones
postraduccionales; Expresión; Funciones en la célula; Metabolismo;
Implicación en enfernedades; Anticuerpos monoclonales; Purificación;
Manipulación; Modelos animales; Investigadores; Recuros en la web;
Referencias.
Centro
de recursos e información sobre encefalopatía espongiforme
transmisible [S. Dealler].
Enfermedades
priónicas [Prionics AG]. Sitio
web en inglés, francés, alemán e italiano.
en EE.UU.:![]() ![]() |
(con problemas de velocidad). | |
en España:![]() |
Lista
de direcciones del PGH [Stanford Human
Genome Center].
Páginas
de información de los cromosomas humanos
[HUGO].
Cómo
se secuencia un genoma: fragmentación del
cromosoma, clonación, preparación del DNA para la detección,
secuenciación didesoxi, ensamblado de secuencias de los fragmentos.
[NOVA Online]. También
sin
usar Flash.
Visión
general de terapia génica [Access Excelence].
Visión
general de terapia génica [Human Genome Project Information].
Terapia
génica y posibles aplicaciones en el transplante clínico
[Fry & Wood, Expert Reviews in Molecular Medicine, 1999].
Cómo
extraer DNA del germen de trigo: cómo aislar grandes
cantidades de DNA en tu casa (alcohol, detergente, ablandador de carne
y germen de trigo) [Genetic Science Learning Center, Univ. of Utah].
Guide
to statistics and data analysis [LC·GC Europe Online Supplement]
Una
serie de 7 artículos, 4 teóricos y 3 ejemplos de aplicación.
Combina bien un planteamiento introductorio con una cierta profundidad.
Distribución, media, dispersión, análisis de varianza,
regresión, calibración, valores erráticos, estadística
robusta, métodos no paramétricos. (formato
pdf).
Centrifugación
[Joaquín Rodríguez Pinilla]. Principios físicos,
ecuaciones, coeficiente de sedimentación; tipos; instrumentación.
Centrifugación analítica. Centrifugación preparativa:
diferencial, en gradiente, zonal, isopícnica. Gradientes: solutos,
tipos. Aplicaciones.
Fraccionamiento
subcelular [M.Reina, Univ. Barcelona]. Introducción.
Técnicas de rotura de células y tejidos. Centrifugación.
Centrífugas. Centrifugación diferencial. Velocidad de sedimentación.
Equilibro de sedimentación: centrifugación en gradiente de
densidad. Algunos recursos de utilidad en centrifugación. Aislamiento
de orgánulos.
Animación
de fraccionamiento celular.
Fraccionamiento
celular por ultracentrifugación [M.Loewen, National Research Council
of Canada].
Experimento
de Meselson y Stahl [W.H.Freeman]. En este experimento biológico
clásico, se utilizó la centrifugación en un gradiente
de densidad de CsCl para demostrar que la replicación del DNA tenía
lugar de forma semiconservadora.
Descripción
general y aplicaciones (breve) [Dr. A.Gascón,
Hospital «Obispo Polanco» de Teruel]
[CNB,
Univ.Autónoma Madrid]: Buen resumen
Purificación
de DNA y RNA [Univ.Paris VI] (en francés)
Investiga
un poco: ensayo de viabilidad celular
LIVE/DEAD® de Molecular Probes: descripción,
compendio de información
(descripción, fundamento, datos del producto, fórmulas, espectros,
fotos de ejemplo...)
FACS
Laboratory [Cancer Research UK]. Teoría y aplicaciones
de la citometría.
Biochem
4113 Recombinant DNA Lectures: Notas esquemáticas y enlaces.
Guía
de Quiagen para la selección de
reactivos de transfección (formato pdf).
Clonación:
pasado, presente y excitante futuro: artículo introductorio
y divulgativo, de FASEB Breakthroughs in Bioscience. Incluye historia.
En
línea y en pdf.
Molecular
Medicine in Action: El ciclo de vida de un retrovirus
(Busca la sección "Viral vectors" en el menú de la izquierda).
Manipulación
de genes: Introducción. Métodos para la inserción
de genes. Bacterias y virus como portadores de genes. Métodos mecánicos.
Marcadores. Promotores. Barreras entre especies. ["Genetically Engineered
Food - Safety Problems", Physicians and Scientists for Responsible Application
of Science and Technology].
Técnicas
de DNA recombinante [S.Metzenberg, Curso 'Biology 572', California State
University Northridge, EE.UU.].
Clonación
[Genetic Science Learning Center, Univ. of Utah].
Enzimas
de restricción - Tutorials in Molecular Biology [University
of California, Los Angeles].
Separación e identificación de aminoácidos por cromatografía
en capa fina. Guión (incluye fotos del proceso) de la
práctica en el Departamento de Bioquímica, Biología
Molecular (B) e Inmunología de la Universidad de Murcia.
Separación de biomoléculas por cromatografía de permeación
en gel. Guión (incluye fotos del proceso) de la práctica
en el Departamento de Bioquímica, Biología Molecular (B)
e Inmunología de la Universidad de Murcia.
Separación
a lo largo de una columna [J.Hardy, Univ. Akron, EE.UU.].
Mecanismo
de la exclusión molecular [J.Hardy, Univ. Akron, EE.UU.].
Cromatografía
en capa fina [J.Hardy, Univ. Akron, EE.UU.].
Animaciones
QuickTime, Flash y GIF de electroforesis, espectroscopía, cromatografía,
quimioluminiscencia, etc. [T.G.Chasteen, Sam Houston State Univ.].
Electroforesis.
Curso de Doctorado en la Univ. de La Laguna [Javier Corzo]. Teoría,
tipos, ...
Electroforesis
de DNA en agarosa [MyDNA Discovery Modules, Univ. Massachusetts]
Lo
más básico: carga eléctrica, electroforesis, voltaje,
concentración de agarosa, separación por tamaño, restricción.
Muy
bueno.
Electroforesis
SDS-PAGE en Molecular
Biology Techniques Manual [Coyne, James, Reid y Rybicki, Univ.
de Ciudad del Cabo, Sudáfrica] Bastante completo,
sólo texto; incluye protocolo experimental.
Electroforesis
bidimensional de proteínas [Danish Centre for Human Genome
Research)]. Bases de datos de imágenes de geles 2D. Procedimiento
experimental para hacer la electroforesis, acompañado de fotos y
películas.
Animaciones
QuickTime, Flash y GIF de electroforesis, espectroscopía, cromatografía,
quimioluminiscencia, etc. [T.G.Chasteen, Sam Houston State Univ.].
Acción
de EcoRI [Access Excellence]
REBASE:
Base de datos de enzimas de restricción
Detección
de ácidos nucleicos por hibridación en
Molecular
Biology Techniques Manual [Coyne, James, Reid y Rybicki, Univ.
de Ciudad del Cabo, Sudáfrica].
Hibridación
de Southern - Tutorials in Molecular Biology [University of
California, Los Angeles].
Hibridación
in situ con fluorescencia (FISH). DNA Biophysics Laboratory, Instituto
Pasteur (Francia)
ELISA:
ensayo de embarazo por detección de hCG [Kuby Immunology,
4th. ed., W.H.Freeman].
Molecular Biology Techniques Manual [Coyne, James, Reid y Rybicki,
Univ. de Ciudad del Cabo, Sudáfrica] Bastante completo,
sólo texto; incluye protocolo experimental:
Transferencia Western
Técnica de inmunoadsorción
Obtención de anticuerpos monoespecíficos por afinidad
Tutorials
in Molecular Biology [University of California, Los Angeles].
Presentación de tipo diapositiva con texto, dibujos y animaciones.
PCR
en
Molecular
Biology Techniques Manual [Coyne, James, Reid y Rybicki, Univ.
de Ciudad del Cabo, Sudáfrica]
Bastante completo,
especializado.
PCR
en LaTrobe University, Australia.
Andy
Vierstraete [Univ. de Gante, Bélgica]. Principio de la
PCR, figuras y dibujo animado
BioGuide:
información más especializada; variantes de PCR: "Hot-start",
AP-PCR, RAPD-PCR, "Touchdown".
PCR
Jump Station: colección de recursos y enlaces; casi todo
sobre la PCR (página compleja, nivel avanzado)
Tavi's
PCR protocols - PCR and multiplex PCR: guide and troubleshooting
[O. Henegariu, Yale Univ.] Amplia, técnica.
PCR
de Tabitha M. Powledge [FASEB Office
of Public Affairs]: extensa, sólo texto.
Principles
of Protein Structure (PPS)
Univ.
de Guelph [Ontario, Canadá]
Tutorials
in Molecular Biology [University of California, Los Angeles].
Andy
Vierstraete [Univ. de Gante, Bélgica]: Principio de la
secuenciación didesoxi automática, figuras y dibujos animados.
Análisis
de secuencia del DNA [KUMC Medical
Biochemistry; Univ. of Kansas Medical Center]: presentación
en diapositivas-web o descarga de archivo PowerPoint
Protocol
Online [DoubleTwist.com] - sección Biología Molecular-
DNA: Enlaces a artículos o procedimientos de extracción,
cuantificación, electroforesis, manipulación enzimática,
secuenciación, hibridación Southern, transformación
de células, transfección, clonación, marcado, genotecas,
oligos, mutagénesis y biochips. (También hay otras muchas
secciones).
Véase también
en la sección Libros Virtuales de la colección de enlaces
de BioROM: Protocols for Recombinant DNA Isolation,
Cloning, and Sequencing
Colección de enlaces a material multimedia en la red [Juan Manuel
González Mañas, UPV].
Gráficos
interactivos de El Mundo - Salud.
Macrogalería;
traducción de
[Univ.
Southern Mississippi].
IncluyeTécnicas
para el estudio de polímeros en "Haciendo hablar a los
polímeros": Espectroscopía de infrarrojos,
Viscosidad, Cromatografía de exclusión molecular, Calorimetría
de barrido diferencial, Espectroscopía RMN, Espectroscopía
de masas.
Prácticas
de laboratorio [Proyecto Biotech de
la Univ. de Arizona]: extracción de DNA de kiwi o cebolla, electroforesis
en agarosa, huella dactilar, identificación de mutaciones, PCR,
clonación en bacterias, análisis de restricción, cromatografía,
electroforesis de proteínas, ELISA. Hay guiones para el alumno y
para el profesor, se pueden descargar.
Colección
de animaciones de Química General, Química Orgánica
y Bioquímica [J.Hardy, Univ. Akron, EE.UU.].
Exactitud y Precisión. Ebullición del agua. Átomos.
Orbitales. Representación de puntos de Lewis. Interacción
de Van der Waals. Reactivos limitantes. Energías potencial y cinética.
Cloruro sódico. Barómetro. Presión. Difusión.
Electrólitos. Disolución. Presión de vapor. Ósmosis.
Presión osmótica. Colapso y rotura de los eritrocitos. Colisión
molecular. Catálisis. Valoración. Fisión. Reacción
en cadena. Deteción de fugas. Cámara de niebla. Grafito y
diamante. Esfera "bucky ball". Intercambio de haluro. Etano, eteno y etino.
Cis- y trans-2-butano. Benceno. t-Butanol. Fenol. Vainillina. Ácido
fórmico. Viagra. Heroína. Almidón. Ácidos esteárico,
oleico, araquidónico. Olestra. Entrada de grasas a la célula.
Bicapa lipídica. Colicina Ia. Hélice alfa. Hoja beta. Hemo.
Clorofila A. Hemoglobina. Permeasa. Hemolisina. Proteína del virus
del tomate. Enzimas. Ribozima en cabeza de martillo. Replicación.
tRNA. Transcripción. Traducción. Filtración por gel.
Ácido fólico. Vitaminas B12 y C. Acetil-CoA. NAD+. FAD. Flavoproteínas.
Proteínas Fe-S. Codeína. Morfina.
Interactive
animations [complementario a Interactive Concepts in Biochemistry, 2nd.
ed.; R.Boyer; Wiley, 2002]. Aminoácidos. Catálisis,
Estructura de la célula. Dogma central. Transporte celular. Colesterol.
Ciclo del ácido cítrico. Clonación. Ciclo de Cori.
Replicación. Inhibición enzimática. Especificidad
enzimática. Metabolismo de los ácidos grasos. Gluconeogénesis.
Glucólisis. Introducción al metabolismo. Ubicación
de los procesos metabólicos. Nucleótidos. Fosforilación
oxidativa. PCR. Fotosíntesis. Plegamiento proteico. Síntesis
de proteínas. Complejo piruvato-deshidrogenasa. Restricción
y electroforesis. Transducción de señal.
Animaciones
QuickTime, Flash y GIF de electroforesis, espectroscopía, cromatografía,
quimioluminiscencia, etc. [T.G.Chasteen, Sam Houston State Univ.].