Exemplo 1
Dímero da proteína Cro do bacteriófago lambda; se mostra só uma parte da proteína, a qual corresponde a seus dois motivos hélice-giro-hélice, ligada a um fragmento de DNA de 20 pb.

Cada cadeia se mostra numa cor: os 2 filamentos de DNA e
2 motivos na proteína dimérica.
Para apreciar melhor a estrutura tridimensional, é conveniente girar a molécula (utilizando o botão esquerdo do rato: carregar e deslocar).

A estrutura que é comum as outras proteínas, e por isso se chama motivo, está constituída por:
1) um fragmento em alfa-hélice, que encaixa no sulco maior do DNA e interage directamente com as bases nitrogenadas, chamado por isto "hélice de reconhecimento";
2) um curto fragmento de peptídeo sem estrutura secundária (um giro ou volta, em inglês turn);
3) outra alfa-hélice que fica mais separada do DNA e forma um ângulo fixo com a primeira.
Estes três componentes atribuem o  nome ao motivo. Ademais , cada proteína em particular possui outras regiões em alfa-hélice, giros e bucles que colaboram na estrutura do motivo, e o resto da molécula de proteína, não mostrada.

Modelo espacial compacto

Outro exemplo de proteína com dois motivos hélice-giro hélice
"Repressor lambda", proteína do bacteriófago lambda, ligado ao DNA na região do operador.