Biomodel-5: Biopolímeros

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Conceptos generales de polímeros

Aprende el concepto de hélice y la diferencia entre una hélice dextrorsa y sinistrorsa:

• Modelos de hélice dextrorsa y sinistrorsa:
• Ejercicio:

Examina la estructura helicoidal de varios biopolímeros utilizando los modelos moleculares:

Polisacáridos: celulosa, amilosa, glucógeno { o } Proteínas: estructura en hélice alfa, hemoglobina: { o } y Ácidos nucleicos (DNA): { o } y

También en (UIB)

Colágeno

Estudio de la estructura secundaria característica del tropocolágeno y de las fibrillas de colágeno:

Fotografías al microscopio electrónico de la estructura de las fibras de colágeno: y

Fibroína de la seda de gusano

Estudio de la estructura tridimensional de las regiones cristalinas ( [Gly-Ala-]_n ):

Espidroínas de la seda de araña

Módulo de aprendizaje activo sobre este biomaterial:

Caucho

Estructura del caucho y la gutapercha:

Estructura de ácidos nucleicos

Hélice doble: aprende el concepto y cómo también puede ser dextrorsa o sinistrorsa.

• Modelos de hélice dextrorsa y sinistrorsa:
• Examina la estructura duplohelicoidal del DNA utilizando los modelos moleculares:
  { o }, { o } y
• Haz el ejercicio

Conformaciones de la pentosa: examina la diferencia entre la conformación 2'-endo y la 3'-endo:

Superenrollamiento:

• Módulo de aprendizaje activo:
• Ejercicio

Estructura de polipéptidos y proteínas

Estructura de los aminoácidos: o { o }.

Estereoisomería de los aminoácidos: aprende a diferenciar las series D y L, y su relación con la configuración absoluta (R/S)

Estereoquímica del enlace peptídico: coplanariedad, ángulos de rotación phi y psi:
(1), (2) y (3) [UMa, UIB].

Ejercicio de conformación y gráfica de Ramachandran:

Reglas de nomenclatura para especificar la conformación de cadenas polipeptídicas: (IUPAC-IUB JCBN)

Estructura secundaria de los polipéptidos:

• Hélices diversas:
• Láminas beta:

Secuenciación de polipéptidos: ejercicios

Estructura de oligosacáridos y polisacáridos

Modelos moleculares de mono-, di-, oligo- y poli-sacáridos: { o } y (UIB).

Determinación de la estructura: ejercicio .

Nomenclatura recomendada: IUPAC-IUBMB Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN).

Biosíntesis de ácidos nucleicos

La estructura y función de la transcriptasa inversa:

Síntesis química de oligonucleótidos

Ejercicios:

Biosintesis de proteínas y péptidos

El código genético .

Estructura molecular tridimensional del ribosoma .

Estructura del RNA de transferencia: { o } y .

Esquemas animados de síntesis de proteínas .

Estructura tridimensional de péptidos cíclicos .

Síntesis química de péptidos

Nomenclatura recomendada:

Ejercicios:

Plegamiento de proteínas

Estructuras supersecundarias

Manojo o haz de 4 hélices y efecto hidrófobo

Carabinas moleculares

Complejo GroEL:GroES (familias Hsp60 y Hsp10)

• Modelos moleculares:
• Cambios conformacionales:
• Página en PDB Molecule of the Month:

Análisis de conformación de macromoléculas