La
hélice
a
derechas es la más abundante en las proteínas globulares. Su conformación
es muy estable y corresponde a una posición central de una de las regiones
permitidas del mapa
= -57º y
= -47º. En este tipo de estructura
el esqueleto peptídico se encuentra enrollado de forma compacta alrededor
del eje longitudinal de la molécula, y las cadenas laterales.
En el ejemplo la hélice alfa está formada por un polipéptido de 20 aminoácidos (hélice de la mioglobina). Los átomos pueden identificarse por su color (C, H, N, O, P, S) y está representada en la forma de varillas.
El esqueleto peptídico (el eje de la hélice) se muestra
en amarillo. y los C
en
gris. Observar cómo las cadenas laterales se dirigen hacia el exterior.
hélice a se encuentra estabilizada:
Puentes de
hidrógeno entre el grupo carbonilo y el grupo amida del enlace peptídico de
los restos i e i+4, respectivamente. En gris se representan los C
.
Establecimiento de interacciones de Van der Waals entre
los átomos a través de su eje, ya que el radio de la hélice es 2,3Å.
La
hélice es dextrógira (avanza en el sentido de las agujas del reloj vista desde arriba).
Cada residuo gira
100º con respecto al anterior
y se desplaza 0,15 nm con respecto al residuo anterior.
Son necesarios 3,6
residuos y 0,54 nm, para dar una vuelta completa de la hélice.