Los aminoácidos pueden unirse covalentemente mediante un enlace amida substituido, llamado enlace peptídico dando lugar a un péptido. El enlace peptídico se forma por eliminación de una molécula de agua entre un grupo carboxilo de uno de los aminoácidos y del grupo -amino del otro:

El enlace peptídico tiene características de doble enlace debido a la presencia de estructuras resonantes. Lo que determina que se encuentre situado en un plano .

De esta coplanaridad se desprende que las únicas libertades de giro se sitúan en los enlaces de los carbonos , que así sirven de nexo de unión entre los distintos planos que componen el esqueleto de la proteína. Para cada uno de los C se definen dos ángulos, (phi) y (psi), que corresponden a la rotación de los enlace C i-Ni y C i-Ci', respectivamente. Si se conoce el valor de estos ángulos para cada uno de los C , la disposición espacial de la cadena polipeptídica queda definida exactamente.